Lik sin bror, Ninja 125, har Ninja e-1 et tiltrekkende, helkåpechassis som skaper oppmerksomhet og gir inntrykk av en større motorsykkel. Dette inntrykket blir forsterket av det høykvalitets designet og utførelsen, som kan sammenlignes med motorsykler fra en større sylinderklasse. LED-lys rundt om gir motorsykkelen et moderne, høyteknologisk utseende.